Annak érdekében, hogy eltüntetésük hatékony legyen, a legmodernebb eszközökre van szükség. Általában olyan penészölőket alkalmaznak, melyek aktív klórt, aldehideket, alkoholt, ammóniumvegyületeket, organikus savakat, peroxidokat tartalmaznak. Az érintett terület minőségétől, terjedelmétől és elhelyezkedésétől függően kell penészölő fertőtlenítőszert választani.

A fertőtlenítés azonban csak átmeneti megoldást jelent a penésszel szemben. A tartós eltávolítás csak a penész kialakulásáért felelős okok felkutatása után lehetséges. Ezért nagyon fontos a penész ellen vívott küzdelemben a megelőzés, amelyben segít a lakott területek megfelelő szellőzése (elkerülve az ún. üvegház effektust), hogy biztosítva legyen a megfelelő légáramlás (rendszeres aktív szellőztetés főleg a konyhában, fürdőszobában, pincében, kamrában, mosókonyhában), a hatékony légelszívók használata (főleg a konyhában és a fürdőszobában), a megelőző jelleggel bíró penészölő szerek használata. A leghatásosabb penészölő azonban mindig a friss levegő és a napfény marad. A lakás optimális hőmérséklete 19-21°C közt van, a hálószobáé 18°C, az optimális páratartalom pedig 45-55% között mozog, nem szabad, hogy elérje a 60%-t. A penész likvidálásakor többfajta metódust alkalmazhatunk: mechanikus – penészeltávolítás a felületről nedves kaparással, hogy a spórák ne tudjanak továbbterjedni a levegőben; fizikai – az érintett felület UV sugárral történő sugárzása, gamma sugárzás, mikrohullámú sugárzás; biológiai – megfelelő antiinfektív szer használata; ebben az esetben azonban problémát jelent a használt szer nem elégséges ellenőrizhetősége; veszélyeztetheti a kezelt felület épségét, mivel ezek sok esetben organikus savakat produkálnak; használhatóak kémiai szerek bevonatok, permetek, bevonók formájában.